Borja Alonso es Ingeniero de Caminos, Canales y Puertos y Doctor por la Universidad de Cantabria. Actualmente, es Profesor Titular en el área de Ingeniería e Infraestructura de los Transportes en la UC y también ejerce como subdirector de la EDUC. Desde el año 2010, ha venido desarrollando su labor docente con un enfoque especializado en microsimulación y macrosimulación del tráfico.

Sus líneas de investigación se centran en el análisis operacional de redes de tráfico, diseño de sistemas de transporte público y modelos de comportamiento del usuario. Este enfoque multidisciplinario le ha permitido dirigir más de 10 proyectos competitivos a nivel nacional y participar en 3 proyectos europeos. Además, su contribución académica es reconocida ampliamente, ya que forma parte del consejo editorial de varios números de revistas de alto impacto en la disciplina.